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小規模事業者持続化補助金は後払い|第20回の締切と上限

小規模事業者持続化補助金は後払い|第20回の締切と上限

販路開拓の取り組みに使える小規模事業者持続化補助金は、小規模事業者にとっていちばん身近な補助金です。ただ、資金繰りという観点で見ると、使う前に知っておかないといけない性質があります。

それは補助金が後払いだということです。先に自分で全額を払い、事業が終わってから報告して、額が確定してはじめて振り込まれます。ここでは第20回公募の公募要領と交付規程、中小企業庁の資料だけを突き合わせて整理します。

■ この記事の結論
  • ▸補助金は後払い。交付規程20条1項は「補助金は…額を確定した後に支払うものとする」と定めています。請求書の様式名も「補助金精算払請求書」です
  • ▸第20回の申請受付は2026年11月5日から12月15日17時まで。ただし商工会・商工会議所が出す事業支援計画書(様式4)の発行受付締切は12月4日で、11日早い日付です
  • ▸自己負担分とつなぎの資金にはマル経融資を使える、と中小企業庁のチラシが明記しています。持続化補助金のチラシにもマル経が載っていて、相互に書かれています
  • ▸ウェブサイト関連費の上限は公募要領と交付規程で決め方が違います。公募要領は30万円、交付規程の様式は補助金総額の4分の1です

第20回の日程と金額をまず押さえる

持続化補助金の補助上限と補助率、補助金が後払いであること
持続化補助金の補助上限と補助率、補助金が後払いであること(2026年10月26日時点)
第20回公募の日程と金額(公募要領 第8版から)
公募回第20回公募(一般型 通常枠)。公募要領は第8版・2026年7月21日
公募要領の公開2026年5月27日
申請受付開始2026年11月5日
申請受付締切2026年12月15日 17:00
事業支援計画書(様式4)の発行受付締切2026年12月4日
採択発表2027年3月頃予定
見積書等の提出期限2028年2月29日(提出がないと採択取消し)
補助事業の実施期限交付決定日から2028年3月31日まで
実績報告書の提出期限2028年4月10日
補助上限50万円。インボイス特例で50万円、賃金引上げ特例で150万円、両方で200万円の上乗せ
補助率3分の2(賃金引上げ特例のうち赤字事業者は4分の3)
申請方法電子申請システムのみ。郵送は受け付けない
2026年10月26日に第20回公募の公募要領 第8版(商工会議所地区・商工会地区の両方)で確認。公募要領は改定されることがあります。
⚠ 実質の締切は12月15日ではない
日程で先に見るべきなのは申請の締切ではなく、様式4の発行受付締切の12月4日のほうです。公募要領は「受付締切以降の発行依頼は、いかなる理由があってもできません」と三か所で繰り返しています。しかも商工会地区は窓口での面談が必要な運用で、事務局は「様式4の交付に時間を要する場合があります」と別に注意しています。第19回は様式4の締切と申請締切の差が14日、第20回は11日です。前回と同じ感覚で逆算すると3日分ずれます。
要点動かせない日付は12月4日。様式4の発行が間に合わないと申請そのものができません。

いちばん大事なのは「補助金は後払い」であること

“(補助金の支払)第20条 補助金は、前条の規定により交付すべき補助金の額を確定した後に支払うものとする。2 補助事業者は、前項の規定により補助金の支払を受けようとするときは、様式第9による「小規模事業者持続化補助金に係る補助金精算払請求書」を商工会議所地区事務局に提出しなければならない。
— 小規模事業者持続化補助金 交付規程(2026年3月6日改定)第20条

公募要領の1ページ目にも、注意事項として一行だけ置かれています。「補助事業遂行の際には自己負担が必要となり、補助金は後払いです。」

よくあるご質問が示している流れは次のとおりです。

  1. 公募申請
  2. 採択
  3. 経費の価格の妥当性を証明できる見積書等(相見積もりを含む)を提出
  4. 交付決定
  5. 補助事業の実施(ここで自分で全額を支払う)
  6. 実績報告
  7. 確定検査・補助金額の確定
  8. 請求
  9. 入金
!専門目線ポイント!

交付規程35ページを通して「概算払」という語は出てきません。定められている支払方法は精算払だけです。「先に一部もらえるのでは」という前提で資金繰りを組むと、どこかで行き詰まります。

交付決定までの期間も、資料によって示している数字が違います。交付規程9条3項は「通常要すべき標準的な期間は、30日とする」と書きますが、同じ補助金の公募要領は「採択発表から概ね1〜2か月かかる場合があります」と三か所で書いています。どちらも公的な数字です。

実績報告のあとの待ち時間を数字で示しているのは、商工会地区の事務局のお知らせだけです。「実績報告の審査には、提出から3〜4週間程度を要しております」「不備修正が複数回生じた場合、補助金額の確定までに3か月程度を要することがあります」。支払った日から入金まで、半年以上あくことを前提に考えるのが実務的です。

要点補助金は全額を自分で払ったあとに精算払いで戻ってくる制度です。

自己負担とつなぎの資金について、中小企業庁が書いていること

では、その先払いの原資をどうするのか。これについては中小企業庁が二枚のチラシで相互に答えを書いています。

マル経融資のチラシ(令和8年4月8日時点版)
  • ・活用事例の欄に、持続化補助金の補助上限と補助率の図を置いたうえで
  • ・「◎本補助金の自己負担分やつなぎの融資にご利用いただけます。詳しくは、お近くの商工会、商工会議所にお問い合わせください。」
持続化補助金のチラシ(令和8年5月27日時点版)
  • ・関連融資制度の欄に
  • ・「補助対象経費の資金調達に活用できる無担保・無保証の融資制度「小規模事業者経営改善資金(マル経融資)」◎限度額:2,000万円」

どちらも中小企業庁が出しているチラシです。持続化補助金の自己負担分とつなぎをマル経でという組み合わせは、国の側が公的に示している道筋だということになります。マル経の条件はマル経融資の金利と限度額で整理しています。

!専門目線ポイント!

ただし、この結びつけが書かれているのは中小企業庁のチラシだけです。全国商工会連合会の金融支援のページにはマル経の説明はありますが、持続化補助金やつなぎという言葉は出てきません。日本商工会議所のページも両方を並べて紹介するにとどまります。窓口で「チラシに書いてある組み合わせです」と言えるようにしておくと話が早く進みます。

マル経以外のつなぎ資金について書いた公的資料は見つかりませんでした。中小企業庁が名前を挙げているのはマル経だけです。マル経は商工会・商工会議所の推薦を前提とする制度なので、様式4の相談と同じ窓口で話を進められる、という点も実務上は大きい部分です。

要点自己負担とつなぎにマル経を使えることは、中小企業庁の二枚のチラシに書かれています。

対象になる経費と、ウェブサイト関連費の上限が2通りある件

補助対象経費は8つの区分に分かれています。①機械装置等費 ②広報費 ③ウェブサイト関連費 ④展示会等出展費 ⑤旅費 ⑥新商品開発費 ⑦借料 ⑧委託・外注費。どれも「交付決定日以降に発生し補助事業期間中に支払が完了した経費」であることが条件です。

ウェブサイト関連費の上限が公募要領と交付規程で違うことの対比
ウェブサイト関連費の上限が公募要領と交付規程で違う(2026年10月26日時点)
資料ウェブサイト関連費の上限日付
公募要領 第20回 第8版当経費の補助金交付申請額の上限は30万円(税込)2026年7月21日
交付規程 別紙3 様式第8(支出内訳書)補助金総額の4分の1が上限(最大50万円)2026年3月6日改定
公募要領 第19回 第6版(前回)補助金交付申請額の4分の1(最大50万円)前回の公募
第20回の公募要領と、現在公開されている交付規程の様式の記載を並べたもの。2026年10月26日時点。
!専門目線ポイント!

ここは実務で詰まりうる箇所です。公募要領どおり30万円で組むと、補助金総額が50万円の事業者は交付規程の様式の条件に当たらなくなります。50万円の4分の1は12万5千円だからです。交付規程の様式第8には「いいえの場合は実績報告ができません」という注も付いています。

変更そのものは事務局が出している新旧対照表で確認できます。第6版の「補助金交付申請額の1/4(最大50万円)」が、第8版で「当経費の補助金交付申請額の上限は30万円(税込)」に差し替わっています。公募要領が2026年7月21日、交付規程が2026年3月6日なので、交付規程のほうが追いついていない形です。ウェブサイト関連費を大きく積むつもりなら、申請前に事務局へ確認しておくのが安全です。

ほかに押さえておきたい条件を並べます。

経費まわりで押さえておくこと
  • ✓ウェブサイト関連費だけでの申請はできない。必ずほかの経費と一緒に申請する
  • ✓発注総額(1件あたり)50万円超(税込)は2者以上からの見積が必要
  • ✓中古品は金額にかかわらず全件2者以上の見積が必須。個人やオークションからの購入は対象外で、修理費用も対象外
  • ✓展示会等への出展の申込みだけは、交付決定前の申込みでも対象になる(請求書の発行は交付決定日以後)
⚠ 注意
補助対象外の経費の列挙には、金融機関などへの振込手数料・インターネットバンキング利用料・決済手数料、駐車場代・保証金・敷金・仲介手数料・光熱水費、電話代・インターネット利用料金等の通信費、税理士や公認会計士に支払う税務申告・決算書作成の費用、訴訟のための弁護士費用などが並んでいます。販路開拓の取り組みそのものにかかる費用かどうかが線引きです。

「小規模事業者」の線引きは、法律と政令に分かれている

業種常時使用する従業員の数根拠
商業・サービス業(宿泊業・娯楽業を除く)5人以下小規模事業者支援法2条1項2号
サービス業のうち宿泊業・娯楽業20人以下同法施行令1条(1号・2号)
製造業その他20人以下小規模事業者支援法2条1項1号
商工会及び商工会議所による小規模事業者の支援に関する法律および同法施行令の条文から。2026年10月26日時点。

公募要領は3行の表の前に「『商工会及び商工会議所による小規模事業者の支援に関する法律』において、業種ごとに従業員数で小規模事業者であるか否かを判断しています」と書いています。ただ、宿泊業・娯楽業の20人という数字は法律の条文ではなく政令のほうにあります。法律2条1項3号が「政令で定める業種」に委ね、施行令1条がはじめて「一 宿泊業 二十人/二 娯楽業 二十人」と定めている作りです。

!専門目線ポイント!

もうひとつ、公募要領は「常時使用する従業員」について「『中小企業基本法』上の常時使用する従業員をいい」と書いていますが、中小企業基本法にこの語の定義を置いた条文は置かれていません。同法で出てくるのは2条各号と5項の基準としてだけです。実際の中身は公募要領が続けて書いている「労働基準法20条の規定に基づく『解雇の予告を必要とする者』」のほうで、日雇労働者・2か月以内の期間を定めて使用される者・季節的業務に4か月以内の期間を定めて使用される者・試用期間中の者、会社役員や同居の親族従業員は含まれません。

加えて、法律が定義するのは「小規模事業者」で、中小企業基本法2条5項が定義するのは「小規模企業者」です。後者には「おおむね」が付き、宿泊業・娯楽業の例外もありません。判定の根拠は小規模事業者支援法と施行令のほうだ、と押さえておけば迷いません。

要点宿泊業・娯楽業の20人は政令の数字。判定の根拠は小規模事業者支援法と施行令です。

採択されても1円も出ないことがある

補助金の怖いところは、お金を使い切ったあとに不交付が決まりうる点です。公募要領は複数の箇所で同じ趣旨を繰り返しています。

交付決定のあとでも補助金が出なくなる場面
  • ✕インボイス特例を希望した場合、要件を1つでも満たさないと上乗せ部分だけでなく全体が交付対象外になる
  • ✕賃金引上げ加点を受けて採択されても、要件を満たさない場合は「交付決定後であっても、補助金は交付されません」
  • ✕小規模事業者卒業加点も「この要件を満たさない場合は、交付決定後であっても、補助金の交付は行いません」
  • ✕実績報告時までに従業員が退職するなどで1人あたり給与支給総額の年平均上昇率を算出できなくなった場合も交付されない
  • ✕補助事業終了後の補助金額確定にあたり、補助対象物件や帳簿類の確認ができない場合は、その金額は補助対象外

なお、第20回から賃金引上げ特例の要件そのものが入れ替わっています。前回までは「事業場内最低賃金を+50円以上」でしたが、第20回は「2027年4月1日から補助事業実施期限日までの期間と前年同月の12か月を比べ、従業員1人あたり給与支給総額が年平均3.0%以上増加した事業者」です。加点のほうも「+30円以上」から「年平均2.0%以上増加」に変わりました。

⚠ 注意
中小企業庁の持続化補助金のページには、賃金引上げ特例の要件を「事業場内最低賃金を50円以上引き上げる小規模事業者」と書いた概要紙と、「給与支給総額が年平均3.0%以上増加した事業者」と書いたチラシが並んで置かれています。前者は本文に年月の表示がないため、どちらの回のものか読者側では分かりません。要件は第20回の公募要領で確認してください。

申請の段取りで詰まりやすいところ

申請まわりで押さえておくこと(公募要領 第8版とGビズIDのお知らせから)
GビズID電子申請にはGビズIDプライムまたはメンバーのアカウントが必要。暫定プライムアカウントは使えない
公募要領の目安「アカウントの取得には数週間程度を要します」
GビズID側の案内法人代表者によるオンライン審査は24時間365日速やかに、書類申請の審査期間は最大1か月(2026年7月9日のお知らせ)
加点の選び方重点政策加点と政策加点からそれぞれ1種類、合計2種類まで。2種類以上を選ぶと加点審査の対象にならない
応募件数同一事業者からの同一受付締切回への応募は1件。複数の屋号を使う個人事業主も1件のみ
個人事業主の提出書類直近の確定申告書(第一表・第二表+収支内訳書、または所得税青色申告決算書)。開業日が記載されていない開業届は無効
過去の採択過去の補助事業の実施回数等に応じて段階的に減点調整が行われる
審査非公開・書面のみ。提案内容に関するヒアリングは行わず、審査結果の内容についての問い合わせにも応じない
2026年10月26日に確認。
!専門目線ポイント!

GビズIDの所要期間は、公募要領とGビズID側で前提が噛み合っていません。公募要領は「数週間程度」ですが、GビズID側はオンライン審査なら速やかに、書類申請なら最大1か月と二つに分けて案内しています。しかもこの書類申請の期間は2026年7月9日に最大2週間から最大1か月へ延びました。公募要領 第8版はその後の7月21日付ですが、表現は「数週間程度」のままです。

逆算すると、書類申請で最大1か月かかり、そのあとに様式4の発行依頼(商工会地区は窓口面談)があり、その締切が12月4日です。マイナンバーカードがあってオンライン申請できるなら時間はほとんどかからないので、まずそちらを確認するのが早道になります。

件数の目安も載せておきます。中小企業庁が公表しているのは申請件数と採択件数で、採択率という数字そのものは公表されていません。以下は当サイトで割り算したものです。

公募回申請件数採択件数
第17回(2025年9月26日発表)23,365件11,928件
第18回(2026年3月26日の修正後)17,318件8,229件
第19回(2026年7月29日発表)16,576件7,819件
中小企業庁のプレスリリースの数字。割合にすると順に51.0%・47.5%・47.2%(当サイトで計算)。第18回は2026年3月17日の発表では8,330件でしたが、要件を満たしていない案件101件が含まれていたとして3月26日に8,229件へ修正されています。

交付決定を待つあいだの資金をどうするか

補助金は、使ったお金が戻ってくるまでに半年以上かかることがあります。その間の運転資金をどう手当てするかは、採択の前に決めておく話です。マル経融資のほかに、期日前の売掛金を先に現金化する方法もあります。手数料の考え方や必要書類は会社ごとに違うので、条件を並べて見比べてください。資金繰り全体の組み立ては資金繰り表の作り方と個人事業主の資金調達も参考になります。

主要ファクタリング比較

会社手数料最短入金対象必要書類
株式会社No.12社間0.5〜15%/3社間0.5〜5%最短30分法人・個人事業主2点〜公式
イージーファクター2〜8%最短60分法人・個人事業主3点公式
ファクタープラン記載なし(LPは1.8〜8%)最短即日法人のみ2点+契約時4点公式
アクセルファクター2社間1.0%〜/3社間0.5%〜最短2時間法人・個人事業主3点公式
日本中小企業金融サポート機構1.5%〜最短3時間法人・個人事業主2点公式
QuQuMo(ククモ)1%〜(上限非公表)最速2時間法人・個人事業主2点公式
PAYTODAY1〜9.5%最短30分法人・個人事業主4点公式
labol(ラボル)一律10%最短30分フリーランス・個人事業主3点公式
ペイトナーファクタリング一律10%+振込手数料330円最短即日個人事業主・法人3点公式
各社公式サイトの公表値(2026年9月9日時点)。手数料の「〇%〜」は下限値で、実際の料率は審査結果によって決まります。

PR/表内の「公式」は提携リンクです。クリックしても利用条件は変わりません。掲載順と評価の決め方は掲載基準・評価方法で公開しています。

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このページの数値と引用は、すべて公募要領・交付規程と中小企業庁が公開している資料の記載を直接確認したものです。他媒体の数字の転載や、当サイトの推測は使っていません。記載が確認できなかった項目は書いていません。(確認日:2026年10月26日/各資料の記載は予告なく変更されることがあります)

出典:小規模事業者持続化補助金 第20回公募 公募要領 第8版(商工会議所地区) ・ 小規模事業者持続化補助金 交付規程(2026年3月6日改定) ・ 第20回公募 申請時によくあるご質問 ・ 公募要領 新旧対照表(第6版・第7版から第8版) ・ 商工会地区 小規模事業者持続化補助金事務局 ・ 商工会議所地区 小規模事業者持続化補助金事務局 ・ 中小企業庁「小規模事業者持続化補助金について」 ・ 中小企業庁 持続化補助金(通常枠)チラシ 令和8年5月27日時点版 ・ 中小企業庁 マル経融資チラシ 令和8年4月8日時点版