小規模事業者持続化補助金は後払い|第20回の締切と上限

販路開拓の取り組みに使える小規模事業者持続化補助金は、小規模事業者にとっていちばん身近な補助金です。ただ、資金繰りという観点で見ると、使う前に知っておかないといけない性質があります。
それは補助金が後払いだということです。先に自分で全額を払い、事業が終わってから報告して、額が確定してはじめて振り込まれます。ここでは第20回公募の公募要領と交付規程、中小企業庁の資料だけを突き合わせて整理します。
- ▸補助金は後払い。交付規程20条1項は「補助金は…額を確定した後に支払うものとする」と定めています。請求書の様式名も「補助金精算払請求書」です
- ▸第20回の申請受付は2026年11月5日から12月15日17時まで。ただし商工会・商工会議所が出す事業支援計画書(様式4)の発行受付締切は12月4日で、11日早い日付です
- ▸自己負担分とつなぎの資金にはマル経融資を使える、と中小企業庁のチラシが明記しています。持続化補助金のチラシにもマル経が載っていて、相互に書かれています
- ▸ウェブサイト関連費の上限は公募要領と交付規程で決め方が違います。公募要領は30万円、交付規程の様式は補助金総額の4分の1です
第20回の日程と金額をまず押さえる

| 公募回 | 第20回公募(一般型 通常枠)。公募要領は第8版・2026年7月21日 |
|---|---|
| 公募要領の公開 | 2026年5月27日 |
| 申請受付開始 | 2026年11月5日 |
| 申請受付締切 | 2026年12月15日 17:00 |
| 事業支援計画書(様式4)の発行受付締切 | 2026年12月4日 |
| 採択発表 | 2027年3月頃予定 |
| 見積書等の提出期限 | 2028年2月29日(提出がないと採択取消し) |
| 補助事業の実施期限 | 交付決定日から2028年3月31日まで |
| 実績報告書の提出期限 | 2028年4月10日 |
| 補助上限 | 50万円。インボイス特例で50万円、賃金引上げ特例で150万円、両方で200万円の上乗せ |
| 補助率 | 3分の2(賃金引上げ特例のうち赤字事業者は4分の3) |
| 申請方法 | 電子申請システムのみ。郵送は受け付けない |
いちばん大事なのは「補助金は後払い」であること
“(補助金の支払)第20条 補助金は、前条の規定により交付すべき補助金の額を確定した後に支払うものとする。2 補助事業者は、前項の規定により補助金の支払を受けようとするときは、様式第9による「小規模事業者持続化補助金に係る補助金精算払請求書」を商工会議所地区事務局に提出しなければならない。
公募要領の1ページ目にも、注意事項として一行だけ置かれています。「補助事業遂行の際には自己負担が必要となり、補助金は後払いです。」
よくあるご質問が示している流れは次のとおりです。
- 公募申請
- 採択
- 経費の価格の妥当性を証明できる見積書等(相見積もりを含む)を提出
- 交付決定
- 補助事業の実施(ここで自分で全額を支払う)
- 実績報告
- 確定検査・補助金額の確定
- 請求
- 入金
交付規程35ページを通して「概算払」という語は出てきません。定められている支払方法は精算払だけです。「先に一部もらえるのでは」という前提で資金繰りを組むと、どこかで行き詰まります。
交付決定までの期間も、資料によって示している数字が違います。交付規程9条3項は「通常要すべき標準的な期間は、30日とする」と書きますが、同じ補助金の公募要領は「採択発表から概ね1〜2か月かかる場合があります」と三か所で書いています。どちらも公的な数字です。
実績報告のあとの待ち時間を数字で示しているのは、商工会地区の事務局のお知らせだけです。「実績報告の審査には、提出から3〜4週間程度を要しております」「不備修正が複数回生じた場合、補助金額の確定までに3か月程度を要することがあります」。支払った日から入金まで、半年以上あくことを前提に考えるのが実務的です。
自己負担とつなぎの資金について、中小企業庁が書いていること
では、その先払いの原資をどうするのか。これについては中小企業庁が二枚のチラシで相互に答えを書いています。
どちらも中小企業庁が出しているチラシです。持続化補助金の自己負担分とつなぎをマル経でという組み合わせは、国の側が公的に示している道筋だということになります。マル経の条件はマル経融資の金利と限度額で整理しています。
ただし、この結びつけが書かれているのは中小企業庁のチラシだけです。全国商工会連合会の金融支援のページにはマル経の説明はありますが、持続化補助金やつなぎという言葉は出てきません。日本商工会議所のページも両方を並べて紹介するにとどまります。窓口で「チラシに書いてある組み合わせです」と言えるようにしておくと話が早く進みます。
マル経以外のつなぎ資金について書いた公的資料は見つかりませんでした。中小企業庁が名前を挙げているのはマル経だけです。マル経は商工会・商工会議所の推薦を前提とする制度なので、様式4の相談と同じ窓口で話を進められる、という点も実務上は大きい部分です。
対象になる経費と、ウェブサイト関連費の上限が2通りある件
補助対象経費は8つの区分に分かれています。①機械装置等費 ②広報費 ③ウェブサイト関連費 ④展示会等出展費 ⑤旅費 ⑥新商品開発費 ⑦借料 ⑧委託・外注費。どれも「交付決定日以降に発生し補助事業期間中に支払が完了した経費」であることが条件です。

| 資料 | ウェブサイト関連費の上限 | 日付 |
|---|---|---|
| 公募要領 第20回 第8版 | 当経費の補助金交付申請額の上限は30万円(税込) | 2026年7月21日 |
| 交付規程 別紙3 様式第8(支出内訳書) | 補助金総額の4分の1が上限(最大50万円) | 2026年3月6日改定 |
| 公募要領 第19回 第6版(前回) | 補助金交付申請額の4分の1(最大50万円) | 前回の公募 |
ここは実務で詰まりうる箇所です。公募要領どおり30万円で組むと、補助金総額が50万円の事業者は交付規程の様式の条件に当たらなくなります。50万円の4分の1は12万5千円だからです。交付規程の様式第8には「いいえの場合は実績報告ができません」という注も付いています。
変更そのものは事務局が出している新旧対照表で確認できます。第6版の「補助金交付申請額の1/4(最大50万円)」が、第8版で「当経費の補助金交付申請額の上限は30万円(税込)」に差し替わっています。公募要領が2026年7月21日、交付規程が2026年3月6日なので、交付規程のほうが追いついていない形です。ウェブサイト関連費を大きく積むつもりなら、申請前に事務局へ確認しておくのが安全です。
ほかに押さえておきたい条件を並べます。
- ✓ウェブサイト関連費だけでの申請はできない。必ずほかの経費と一緒に申請する
- ✓発注総額(1件あたり)50万円超(税込)は2者以上からの見積が必要
- ✓中古品は金額にかかわらず全件2者以上の見積が必須。個人やオークションからの購入は対象外で、修理費用も対象外
- ✓展示会等への出展の申込みだけは、交付決定前の申込みでも対象になる(請求書の発行は交付決定日以後)
「小規模事業者」の線引きは、法律と政令に分かれている
| 業種 | 常時使用する従業員の数 | 根拠 |
|---|---|---|
| 商業・サービス業(宿泊業・娯楽業を除く) | 5人以下 | 小規模事業者支援法2条1項2号 |
| サービス業のうち宿泊業・娯楽業 | 20人以下 | 同法施行令1条(1号・2号) |
| 製造業その他 | 20人以下 | 小規模事業者支援法2条1項1号 |
公募要領は3行の表の前に「『商工会及び商工会議所による小規模事業者の支援に関する法律』において、業種ごとに従業員数で小規模事業者であるか否かを判断しています」と書いています。ただ、宿泊業・娯楽業の20人という数字は法律の条文ではなく政令のほうにあります。法律2条1項3号が「政令で定める業種」に委ね、施行令1条がはじめて「一 宿泊業 二十人/二 娯楽業 二十人」と定めている作りです。
もうひとつ、公募要領は「常時使用する従業員」について「『中小企業基本法』上の常時使用する従業員をいい」と書いていますが、中小企業基本法にこの語の定義を置いた条文は置かれていません。同法で出てくるのは2条各号と5項の基準としてだけです。実際の中身は公募要領が続けて書いている「労働基準法20条の規定に基づく『解雇の予告を必要とする者』」のほうで、日雇労働者・2か月以内の期間を定めて使用される者・季節的業務に4か月以内の期間を定めて使用される者・試用期間中の者、会社役員や同居の親族従業員は含まれません。
加えて、法律が定義するのは「小規模事業者」で、中小企業基本法2条5項が定義するのは「小規模企業者」です。後者には「おおむね」が付き、宿泊業・娯楽業の例外もありません。判定の根拠は小規模事業者支援法と施行令のほうだ、と押さえておけば迷いません。
採択されても1円も出ないことがある
補助金の怖いところは、お金を使い切ったあとに不交付が決まりうる点です。公募要領は複数の箇所で同じ趣旨を繰り返しています。
- ✕インボイス特例を希望した場合、要件を1つでも満たさないと上乗せ部分だけでなく全体が交付対象外になる
- ✕賃金引上げ加点を受けて採択されても、要件を満たさない場合は「交付決定後であっても、補助金は交付されません」
- ✕小規模事業者卒業加点も「この要件を満たさない場合は、交付決定後であっても、補助金の交付は行いません」
- ✕実績報告時までに従業員が退職するなどで1人あたり給与支給総額の年平均上昇率を算出できなくなった場合も交付されない
- ✕補助事業終了後の補助金額確定にあたり、補助対象物件や帳簿類の確認ができない場合は、その金額は補助対象外
なお、第20回から賃金引上げ特例の要件そのものが入れ替わっています。前回までは「事業場内最低賃金を+50円以上」でしたが、第20回は「2027年4月1日から補助事業実施期限日までの期間と前年同月の12か月を比べ、従業員1人あたり給与支給総額が年平均3.0%以上増加した事業者」です。加点のほうも「+30円以上」から「年平均2.0%以上増加」に変わりました。
申請の段取りで詰まりやすいところ
| GビズID | 電子申請にはGビズIDプライムまたはメンバーのアカウントが必要。暫定プライムアカウントは使えない |
|---|---|
| 公募要領の目安 | 「アカウントの取得には数週間程度を要します」 |
| GビズID側の案内 | 法人代表者によるオンライン審査は24時間365日速やかに、書類申請の審査期間は最大1か月(2026年7月9日のお知らせ) |
| 加点の選び方 | 重点政策加点と政策加点からそれぞれ1種類、合計2種類まで。2種類以上を選ぶと加点審査の対象にならない |
| 応募件数 | 同一事業者からの同一受付締切回への応募は1件。複数の屋号を使う個人事業主も1件のみ |
| 個人事業主の提出書類 | 直近の確定申告書(第一表・第二表+収支内訳書、または所得税青色申告決算書)。開業日が記載されていない開業届は無効 |
| 過去の採択 | 過去の補助事業の実施回数等に応じて段階的に減点調整が行われる |
| 審査 | 非公開・書面のみ。提案内容に関するヒアリングは行わず、審査結果の内容についての問い合わせにも応じない |
GビズIDの所要期間は、公募要領とGビズID側で前提が噛み合っていません。公募要領は「数週間程度」ですが、GビズID側はオンライン審査なら速やかに、書類申請なら最大1か月と二つに分けて案内しています。しかもこの書類申請の期間は2026年7月9日に最大2週間から最大1か月へ延びました。公募要領 第8版はその後の7月21日付ですが、表現は「数週間程度」のままです。
逆算すると、書類申請で最大1か月かかり、そのあとに様式4の発行依頼(商工会地区は窓口面談)があり、その締切が12月4日です。マイナンバーカードがあってオンライン申請できるなら時間はほとんどかからないので、まずそちらを確認するのが早道になります。
件数の目安も載せておきます。中小企業庁が公表しているのは申請件数と採択件数で、採択率という数字そのものは公表されていません。以下は当サイトで割り算したものです。
| 公募回 | 申請件数 | 採択件数 |
|---|---|---|
| 第17回(2025年9月26日発表) | 23,365件 | 11,928件 |
| 第18回(2026年3月26日の修正後) | 17,318件 | 8,229件 |
| 第19回(2026年7月29日発表) | 16,576件 | 7,819件 |
交付決定を待つあいだの資金をどうするか
補助金は、使ったお金が戻ってくるまでに半年以上かかることがあります。その間の運転資金をどう手当てするかは、採択の前に決めておく話です。マル経融資のほかに、期日前の売掛金を先に現金化する方法もあります。手数料の考え方や必要書類は会社ごとに違うので、条件を並べて見比べてください。資金繰り全体の組み立ては資金繰り表の作り方と個人事業主の資金調達も参考になります。
主要ファクタリング比較
| 会社 | 手数料 | 最短入金 | 対象 | 必要書類 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 株式会社No.1 | 2社間0.5〜15%/3社間0.5〜5% | 最短30分 | 法人・個人事業主 | 2点〜 | 公式 |
| イージーファクター | 2〜8% | 最短60分 | 法人・個人事業主 | 3点 | 公式 |
| ファクタープラン | 記載なし(LPは1.8〜8%) | 最短即日 | 法人のみ | 2点+契約時4点 | 公式 |
| アクセルファクター | 2社間1.0%〜/3社間0.5%〜 | 最短2時間 | 法人・個人事業主 | 3点 | 公式 |
| 日本中小企業金融サポート機構 | 1.5%〜 | 最短3時間 | 法人・個人事業主 | 2点 | 公式 |
| QuQuMo(ククモ) | 1%〜(上限非公表) | 最速2時間 | 法人・個人事業主 | 2点 | 公式 |
| PAYTODAY | 1〜9.5% | 最短30分 | 法人・個人事業主 | 4点 | 公式 |
| labol(ラボル) | 一律10% | 最短30分 | フリーランス・個人事業主 | 3点 | 公式 |
| ペイトナーファクタリング | 一律10%+振込手数料330円 | 最短即日 | 個人事業主・法人 | 3点 | 公式 |
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このページの数値と引用は、すべて公募要領・交付規程と中小企業庁が公開している資料の記載を直接確認したものです。他媒体の数字の転載や、当サイトの推測は使っていません。記載が確認できなかった項目は書いていません。(確認日:2026年10月26日/各資料の記載は予告なく変更されることがあります)



